文獻管理工具 Mendeley vs Papers vs EndNote

EndNote是我用了很久的論文引用工具，雖然還滿容易透過PubMed等下載來建立論文索引，但它跟PDF檔的連結功能一直都很弱，所以文章的PDF檔我還是自己建立很多層的目錄來分類，可是日子一久（加上年紀也大），想要在好幾GB的PDF檔裡面找到想要的文章有時也不容易。

Papers是在Mac上有名的文獻管理工具，不僅有EndNote之類的論文引用功能，更可以很容易分類、檢索、註記大量的論文PDF，建立起個人的文獻資料庫，配合iOS上的行動版，非常強大。雖然它的桌面程式只有Mac版，其他平台無緣使用，但聽說有人為了這個軟體還特別買Mac，所以我在換裝iMac之後立刻就下載試用版，可是一用之下卻相當失望。由於已經有PDF，就先試著把少量(< 100篇）的PDF匯入，看看能不能自動建立文章索引，結果大概只有30%的文章能自動辨識出刊名、作者等資料，而且中間還當掉兩次，穩定度不佳。

前陣子偶然間看到Mobile01介紹Mendeley 這個跨平台（Windows, Mac甚至Linux!)又免費的文獻管理軟體，於是便裝來玩玩。直接將包含5GB的論文PDF檔案夾整個匯入，超過九成都自動辨識出文章的資料，那些辨識不出的主要都是早期用scan方式產生的PDF檔或論文的supplmentary information等，這些只要上網找到相對應的PubMed ID (PMID)或DOI輸入，也很快就能找到文章資訊，相當方便。

文章索引建立好之後，可以加上Tag跟Note來註記，以便更容易搜尋。閱讀PDF跟在上面標記畫線也很方便。Mendeley也提供類似EndNote的引用功能，可安裝plugin到Word或OpenOffice等使用。這些功能都跟Papers相當，而且更好上手。它還可以安裝在brower上的匯入工具，只要在網路上看到喜歡的文章，點一下匯入工具，就可以把文章加入資料庫裡面，超方便。

它也提供iPhone/iPad端的應用程式，可是功能就弱些，只能查閱已建立好的文獻，沒法連到PubMed等去搜尋或新增文章到資料庫裡面，這點目前還是Papers的iPhone版強得多，希望下一版本能加強。

但Mendeley最強大的還不是這些Papers也有的功能，它最主要的強項是雲端。你的所有資料庫基本上是放在雲端，甚至連PDF都可以放（一開始會送1GB空間，要更大的可以付錢升級），所以可以很輕鬆地在不同的電腦及平台上同步。在雲端的另一個賣點就是共享，你可以建立study group，把好文章跟實驗室的夥伴甚至所有的用戶分享，促進交流，有點要建立類似facebook那樣的學術社群，不過目前這方面的討論、發表等功能還很陽春，如果能看到其他人對某一篇文章的評論，那會很有用，希望在之後的版本能做到。

總之，強力推薦Mendeley，Papers跟EndNote可以掰掰了！