Wednesday, March 19, 2008

Varian MRI sucks!

來到新的實驗室,最麻煩的地方除了要適應新的流程、建立實驗環境、動物實驗protocol之外,對玩MRI的我來說另一個就是要適應另一個廠牌的MRI軟硬體。(其實前三者也有很多牢騷,容後再敘。)這裡的機器是Varian 9.4 Tesla的機器,而且算是這家廠商最新的改良版系統--也就是說,我們成了廠商beta testing的白老鼠了。夢魘從此開始。


不講裝機後就花了十個月在debug的鳥事了,首先在硬體方面,居然沒有volume coil發射surface coil接受的設計,得靠協力廠商,可是他們找的協力廠商(Rapid Biomed)的產品每2-3個月就會故障,實在兩光得很;另外他們提供的tune/match工具只有一個數字顯示,完全看不出該tune還是該match。不過它的設計上有個優點,是磁鐵外殼有提供RF shielding,只要把磁鐵兩端開口的門關上即可,不必再建shielding room,可是很兩光的是他們提供的animal holder有時會凸出來,屏蔽門關不起來....

再來是軟體。排除它那很違反直覺、很redudant、很繁複沒有組織的介面設計,以及很古老又慢的自動校正程序(即auto shim, frequency & RF power calibration)不談,之前聽某些人盛讚Varian的軟體多簡單、多有彈性,可是開始寫程式(pulse sequence)之後才覺得並非如此。舉三個例子:

其一,我想自己加入一個迴圈控制影像的擷取,必須告訴系統迴圈執行的順序,這樣影像重建時才會正確,結果問Varian的人該怎麼辦,他們(總共有五六個人前前後後回覆)最後都說,只能用內定好的迴圈順序,沒有辦法更動(這在Bruker的機器上可是輕而易舉呀!)。

其二:128x96的影像重建時想要不用zero fill成128x128,結果答案是不行,得自己寫程式!

其三:自己寫好的pulse sequence要給其他人用得copy好幾個目錄裡的不同檔案,不像大部分廠牌的機器都只要一個執行檔就可。

總之,不管當初是哪個人笨蛋決定買這台機器的,我只能誠心地建議:千萬別買Varian啊!

3 comments:

Anonymous said...

Varain 唯一的好處就是可以 array參數
對 fMRI來說, 可以輕易的在一個時間序列裡做出各種參數組合, 像是 control, ASL, control, ASL...
這點, Bruker只有很難用的 batch可以用

除此之外... Varain沒有其他優點了吧
尤其是他的 VnmrJ介面, bugs滿地爬, 版本越新問題越多


對了, Varain的 ISMRM User Meeting 你會去嗎?

Kai said...

array參數玩得妙的話,是挺方便的。可是Varian沒有提供ASL sequence(Bruker有FAIR),所以我們無論如何還是用自己寫的。不過你現在Varian應該玩得很熟了,該多多跟你請教才是。

User Meeting喔?還是吐槽大會?是該去好好踢一踢他們的屁股才對 XD

Anonymous said...

Varian Users Meeting at 16th ISMRM
http://www.varianinc.com/cgi-bin/nav?products/mri/events/2008/ismrm/index

Varain 最近好像在發展 Continuous ASL
去年有個工程師到我們site, 幫我們升級 VnmrJ 1.1D, 順便問了我們很多 Continuous ASL的問題

如果Dr. Koretsky是用Varain, Varain應該跟他討教才對 呵