Wednesday, May 13, 2009

DICOM format convertor

好久沒有跟研究有關的紀錄了,先來介紹一個軟體。

最近開始在新的MRI上取data,內建的影像格式想當然是臨床常用的DICOM,不過DICOM格式要拿來做後處理很麻煩也很佔空間,最好還是轉成常用的Analyze或新的Nifti格式。目前看來最好用的轉檔軟體應該是MRIConvert,它可以將散佈在不同檔案夾的DICOM檔重新歸整回當初取data時的順序,並可選擇轉換成各種常用的fMRI軟體(SPM, FSL, BrainVoyager)的格式,也可選擇要存成3D或4D檔案。更棒的是還同時支援Windows, Linux跟OSX等平台!大概唯一的缺點是從CDR讀進DICOM資料庫時非常慢,最好還是先把檔案都複製到硬碟再轉檔。

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