3D visualization

無論是做functional imaging或molecular imaging，找到的activation或targeted probe最後最好能以3D視覺呈現在體內的位置。在生醫影像處理中最有名的3D軟體應該是Amira，可是它要價將近7000USD，實在所費不貲，操作介面不夠直覺，而且也沒有夠自動化的segmentation工具能幫你把想3D重建的區域分割下來。此外，最討厭的是手冊寫得密密麻麻，很傷眼也不夠直覺，學習曲線超長。

MIT的AI實驗室跟Brigham and Woman's Hospital合作的3D Slicer是一個當初設計來做手術前定位的軟體，由於它開放式的架構，功能不斷擴充，更整合了fMRI、DTI、Microscopy影像分析、處理、呈現的工具，成為一套功能超強的3D視覺化軟體。使用上簡單得多，且手冊寫清晰簡潔，容易上手。不過缺點就是功能太多，有些擴充功能的說明都不夠完整，不熟的人可要花一點時間嘗試。

這個軟體支援多種平台，從Solaris、Linux、Windows到最新的Mac OS X x86都支援，且是完全免費的，值得大力推薦！